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人免疫缺陷病毒（HIV）是艾滋病的病原体。HIV仅是这类病毒的总称，从基因来源不同上，世界流行的毒株还分为HIV-1和HIV-2两种大类。HIV-2主要在非洲地区流行，感染性和恶性程度均不如HIV-1型。我国主要为HIV-1流行。
HIV-1型又至少可以分为13个亚型，归乃于M、O和N三个组，其中M组有A、B、C、D、E、F、G、H、I、J和K 11个亚型；O组有O亚型和N组有N亚型。HIV-2型至少有A、B、C、D、E、F和G 7个亚型。HIV亚型在病源学、流行病学、实验诊断、临床症状、药物筛查和评估、疫苗研制上颇为重要。当前突出的问题是亚型可变性和亚型重组，对诊断和耐药影响很大。
除了本身亚型的影响，HIV之所以能够在世界上广泛流行，其主要原因就是病毒具有很高的变异性。人体自身免疫系统和抗病毒药物一般通过针对性的干扰病毒上某种酶功能或者攻击特征性生物大分子对抗艾滋病毒。通过变异，病毒改变免疫系统或者抗病毒药物起作用的分子，从而使免疫系统和抗病毒药物失去靶点，逃避攻击。因此，人类免疫系统不能彻底清除艾滋病毒，抗病毒药物也在使用一段时间后，慢慢失去原来效果。世界上对抗艾滋病广泛使用的鸡尾酒疗法（鸡尾酒的特征是几种酒混合在一起调制，鸡尾酒疗法的意思也就是多种抗病毒药物混合搭配使用）的基本原理就是通过多种药物混合使用，避免病毒通过变异而对某种抗病毒药物产生强大的抵抗能力，从而达到长期控制HIV病毒的目的。除掉病毒在病人体内变异，更为严重的是，如果一个人体内存在多种HIV病毒，通过重组，各种亚型的抗药性和致病因子有可能组合到一起，产生抗药性和破坏力更加强大的病毒，加快疾病发展。
因此，在一个人感染了一种艾滋病毒后，如果再被含有其他变异的艾滋病病毒感染，一方面，已经对原来病毒产生抵抗的免疫系统必须再次对新病毒产生免疫应答，加重免疫系统负担，而且不同变异病毒对人体的不同危害也可能造成叠加;另一方面，体内含不同变异的艾滋病毒可能发生重组，使抗药性和致病能力互补，产生抗药性和致病力更强的毒株。
此外，艾滋病致病的主要机理就是破坏人体免疫系统，使人体容易患上其他疾病。许多严重的传染性疾病，如乙肝、梅毒、丙肝等，都可借助和艾滋病感染相同的途径传播。因此，HIV感染者如果感染以上疾病，将比健康人造成更加严重的病情。
艾滋病安全防护是利人利己的行为。作为健康人，在发生艾滋病相关危险行为时候必须要做好安全防护措施；作为HIV感染者，做好安全防护措施更不仅可以保护他人，遏制艾滋病传播，更对保持自己生存质量，延长存活时间具有重要意义。
